Od czerwca 1947r. do czerwca 1957r. funkcję tę pełnił Prof. dr hab. med. B. Michałowski. Następnie - od 26 sierpnia 1957r. do 12 października 1962r. - Prof. dr hab. med. Ksawery Rowiński, a od 12 października 1962r. do 14 kwietnia 1970r. - Prof. dr hab. med. Włodzimierz Kuryłowicz. Od 15 kwietnia 1970 r. do 12 maja 1977r. funkcję Prezesa Fundacji piastował Prof. dr hab. med. Artur Czyżyk, a od 12 maja 1977r. z roczną przerwą na urlop naukowy do 11 września 2001r. (do dnia swojej śmierci) funkcja ta została powierzona śp. Pan Prof. dr hab. med. Witoldowi Rudowskiemu (już od 1970r. Profesor zasiadał w Radzie Fundacyjnej jako przedstawiciel Ministra Zdrowia i Opieki Społecznej).

Od 10 grudnia 2002r. funkcję tę pełnił Pan Prof. dr hab. med. Alfred Jerzy Meissner - Kierownik Kliniki Chirurgicznej Instytutu Hematologii i Transfuzjologii w Warszawie ds. Klinicznych.
W dniu 22 czerwca 2010 roku został odwołany decyzją Ministra Zdrowia a funkcję tę przejął nowopowołany Prof. dr hab. med. Jerzy Woy-Wojciechowski.

Od 1975r. funkcję tę pełnił Pan Prof. dr hab. med. Mieczysław Janowiec - b. vice Dyrektor Instytutu Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie, a następnie kierownik Zakładu Mikrobiologii tego Instytutu.
Dnia 10 maja 2005r. w związku z rezygnacją Prof. dr hab. med. M.Janowca powołany został na to stanowisko przez Radę Fundacyjną Pan Prof. dr hab. med. Edward Towpik. z Kliniki Nowotworów Piersi i Chirurgii Rekonstrukcyjnej, który został wybrany w skład Rady Fundacyjnej w miejsce Przewodniczącego Zarządu Głównego Polskiego Towarzystwa Onkologicznego, nie mogącego pełnić funkcji Członka Rady Fundacyjnej ze względu na nadmiar obowiązków.Kolejny Przewodniczący Zarządu Głównego PTO- prof. Jacek Jassem również nie mógł podjąć się funkcji Członka Rady Fundacyjnej, w związku z czym Rada Fundacyjna uchwałą nr 1/2010 z dnia 26 lipca 2010r. ponownie postanowiła powołać Prof. Towpika w skład Rady, w miejsce Przewodniczącego ZG PTO.
W dniu 17 października 2017r. na stanowisko to powołany został uchwałą Rady Fundacyjnej Przewodniczący Polskiego Towarzystwa Onkologicznego Pan Prof. dr hab. med. Jacek Fijuth.

Od 18 listopada 1987r. aż do swojej śmierci w dn. 18 lutego 2005r. funkcję tę pełnił nieprzerwanie Pan Prof. dr hab. med. Andrzej Hliniak - b. Prezes Zarządu Głównego Polskiego Towarzystwa Onkologicznego i kierownik Zakładu Teleradioterapii Centrum Onkologii w Warszawie.
Od 26 kwietnia 2005r. na stanowisko to powołany został uchwałą Rady Fundacyjnej Dyrektor Instytutu Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie Pan Prof. dr hab. med. Kazimierz Roszkowski-Śliż.

Wszyscy członkowie Rady sprawują swoje funkcje honorowo i nieodpłatnie.

Fundacja posiada w miejscu swojej siedziby biuro, które zajmuje się obsługą administracyjno-księgowych i organizacyjnych spraw związanych z codzienną działalnością Fundacji.

W myśl postanowień art. 20 statutu Fundacji im. Jakuba hr. Potockiego powołano w okresie powojennym na stanowisko dyrektora Fundacji mgr Stanisława Popielarskiego, który pełnił tę funkcję do czasu uzyskania uprawnień dyplomowanego biegłego księgowego, po czym powierzono mu w Fundacji obowiązki Głównego Księgowego, określone w wydanej instrukcji.
Funkcję Głównego Księgowego Pan mgr St. Popielarski pełnił od roku 1958 aż do swojej śmierci w dniu 1 marca 2004r.

Obecny zespół ds. obsługi spraw finansowo-rachunkowych oraz gospodarczych i administracyjno-organizacyjnych Fundacji stanowią:

W celu sprawowania zarządu majątkami Fundacji im. Jakuba hr. Potockiego we Francji powołany został Pełnomocnik Fundacji.

Funkcję tę sprawował nieodpłatnie Dyrektor Generalny Banku Polska Kasa Opieki S.A. w Paryżu, gdzie Fundacja lokowała swoje środki finansowe. Następnie, w związku z restrukturyzacją Banku PKO S.A. Paris zaistniała konieczność ustanowienia nowego pełnomocnika, którym powołana została Pani Grażyna Toulze - Polka, zamieszkała w Paryżu, od wielu lat pomagająca poprzedniemu pełnomocnikowi w prowadzeniu spraw Fundacji we Francji. Obecnie, po przejściu p. G. Toulze na emeryturę, od sierpnia 2013r. funkcję tę pełni p. Małgorzata Grouss.